L’approche DBTL
Qu’est-ce que l’approche DBTL ?
L’application de principes rationnels à la conception et à l’assemblage des composants biologiques d’une voie biologique modifiée constitue un signe distinctif de la biologie de synthèse. Même avec une conception rationnelle, l’impact de l’introduction d’ADN étranger dans une cellule peut être difficile à prédire. Il est donc nécessaire de tester plusieurs permutations pour obtenir le résultat souhaité. L’accent mis sur la conception modulaire des parties d’ADN permet l’assemblage d’une plus grande variété de concepts potentiels en interchangeant les composants individuels. L’automatisation du processus d’assemblage réduit la durée, la main-d’œuvre et les coûts liés à la génération de plusieurs concepts, ce qui permet d’augmenter le débit et d’obtenir un cycle de développement global plus court.
Dans ce processus, des fragments d’ADN double brin sont conçus pour faciliter la construction de gènes. Les concepts assemblés sont généralement clonés dans un vecteur d’expression et vérifiés par qPCR ou séquençage de nouvelle génération (NGS) des colonies. Toutefois, dans certains flux de travail haut débit, cette étape de vérification peut être facultative. Les concepts synthétiques sont ensuite analysés dans divers tests fonctionnels. Après avoir tiré les enseignements des résultats de test, les concepts peuvent être modifiés ou affinés. Ce cycle de conception, construction, test et apprentissage (DBTL) est répété jusqu’à l’obtention d’un concept d’ADN qui produit la fonction souhaitée.
Le cycle Conception-Construction-Test-Apprentissage (DBTL) est un cadre couramment utilisé en biologie de synthèse pour développer et optimiser de manière systématique et itérative des systèmes biologiques, tels que les organismes génétiquement modifiés. Le cycle DBTL est une approche puissante dans la biologie de synthèse pour modifier des organismes afin qu’ils exécutent des fonctions spécifiques, telles que la production de biocarburants, de produits pharmaceutiques ou d’autres composés utiles