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Logiciel d’acquisition et d’analyse d’images à haut contenu MetaXpress

Un logiciel qui transforme vos superbes images en résultats scientifiques impressionnants

Le logiciel MetaXpress® est optimisé en vue d’une utilisation avec les systèmes d’imagerie ImageXpress Micro. Il vous offre un contrôle précis de l’acquisition des images et fournit des outils d’analyse puissants et élégants. Notre assistant unique est gage de vitesse et de commodité. En effet, il vous guide dans toutes vos opérations, telles que : acquisition et analyse des images, autofocus laser, modules d’application préconçus d’analyse d’images, prise en charge du processeur parallèle et planification du transfert automatique des données. Un éditeur de module personnalisé interactif transforme vos connaissances, idées et intuitions en nouvelles routines d'analyse à plusieurs étapes, créées et exécutées en quelques minutes. 

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Des outils d’analyse à plusieurs niveaux couvrant une large gamme d’applications d’imagerie sont disponibles dans un seul et unique logiciel.

  • Modules d’application : solutions clé en main pour les routines d’analyse les plus courantes
  • Modules personnalisés : boîte à outils polyvalente pour des tests avancés, y compris l’analyse structurelle 3D avec mesures de volume, d’intensité et de distance
  • Journaux : puissantes macros d’analyse d’applications complexes et uniques

L’assistant de paramétrage de l’acquisition de plaques guide rapidement les utilisateurs à travers le processus d’acquisition d’image et son optimisation.

  • Le sélecteur d’objectif et d’échantillon vous permet de choisir parmi de nombreux objectifs (1 à 100x) et échantillons (microplaques à empreinte conforme à la norme SBS ou lames de microscope).
  • Affichage interactif du champ afin de faciliter la configuration des sites d’acquisition et la capture des événements rares à l’aide de paramètres optimaux.
  • L’autofocus laser permet la mise au point la plus rapide possible pour compenser la dérive de mise au point induite par les fluctuations de température, les irrégularités de la plaque et la variabilité biologique.
  • L’algorithme d’acquisition adaptatif réduit les temps de lecture des échantillons difficiles et hétérogènes en procédant à l’acquisition d'un nombre de cellules souhaité avant de passer au puits suivant.

La fonction Adaptive Background Correction est utilisée dans tous les modules d’application du logiciel MetaXpress pour compenser l’intensité inégale du bruit de fond afin d’améliorer la segmentation de l’image.

La fonction Adaptive Background Correction réduit
(À gauche) Échantillon à la coloration inégale avant segmentation ; (au centre) après segmentation conventionnelle, certaines des caractéristiques ne sont pas identifiées ; (à droite) avec la fonction Adaptive Background Correction, toutes les caractéristiques sont identifiées.

Des superpositions de données champ par champ, de données cellule par cellule et de segmentation sont disponibles afin de conduire une analyse en aval approfondie, comme par exemple l’identification de différentes populations de cellules ou l’examen de la précision de la segmentation.
Populations de cellules : données cellule par cellule, champ par champ
Tous les paramètres de données peuvent être rapportés sous forme de résumé du champ ou pour chaque cellule individuelle. 
 

Les 18 modules d’application de MetaXpress fournissent des solutions clés en main pour les routines d’analyse les plus courantes. Grâce à une interface interactive, la configuration de ces modules d’application préconçus s’effectue en quelques minutes.

Module d’application Micronuclei

Le module d’application Micronuclei classifie les cellules en fonction de leur morphologie nucléaire pour les applications de génotoxicité, mais il est également tout à fait approprié pour établir la santé des cellules ou les populations de cellules multi-nucléées grâce à des marqueurs supplémentaires d’analyse de l’apoptose et de la nécrose, ou pour distinguer une petite structure se trouvant à proximité d’une grande structure, par exemple un bourgeon de levure.

  • Une classification hautement précise des cellules (micro, mono, bi ou multi-nucléées) est obtenue grâce à un algorithme exclusif afin de discriminer les phénotypes en fonction de la morphologie de la cellule, du nombre de noyaux, de la distance entre les micronuclei et le noyau, les micronuclei par rapport aux « capsules » ou aux « bourgeons ».
  • Nécessite un seul fluorophore (marquage nucléaire) pour identifier les cellules dans diverses classifications, en supprimant la nécessité d’utiliser un marquage cytoplasmique, ce qui réduit donc le temps de préparation de l’échantillon, ainsi que la durée d’acquisition et d’analyse de l’image.
  • L’utilisation de deux fluorophores supplémentaires facilite l’analyse phénotypique, comme les marqueurs de transfection pour identifier les cellules transfectées ou les marqueurs kinétochores pour différencier les micronuclei provenant de clastogènes (qui créent des fragments chromosomiques acentriques) ou d’aneugènes (qui causent des pertes de chromosomes complets).
Module d’application Micronuclei
Images de noyaux cellulaires, avant (à gauche) et après (à droite) une segmentation d’image.
Les cellules micronucléi, binucléées et multinucléées détectées par le module d’application
sont mises en évidence. En tout, plus de 60 mesures par image et de 30 mesures par cellule
sont disponibles pour faciliter l’identification de la vaste gamme de phénotypes associés aux
études de génotoxicité.

Module d’application Neurite Outgrowth

Le module d’application Neurite Outgrowth a été conçu pour mesurer et caractériser les excroissances, prolongements du corps cellulaire, qui font naturellement partie du développement neuronal. L’inhibition ou la stimulation de l’excroissance des neurites intervient dans un large éventail de désordres ou de lésions neurologiques, notamment dans les accidents vasculaires cérébraux, la maladie de Parkinson, la maladie d’Alzheimer et les lésions de la moelle épinière.

  • Dosage unique ne pouvant pas être effectué sans imagerie
  • Fournit des résultats homogènes plus rapidement qu’un tracé et un comptage manuels.
  • Les paramètres de sortie, par champ ou par cellule, peuvent inclure le nombre d’excroissances, les longueurs moyennes ou maximales, les branches, la rectitude, le nombre de cellules ou la taille du corps cellulaire, ou encore le pourcentage avec croissance significative.
Module d’application Neurite Outgrowth
(À gauche) Images de neurones colorés par fluorescence. (À droite) Après segmentation de l'image.
Chaque excroissance est attribuée à un corps cellulaire. Tous les corps cellulaires et excroissances sont
ensuite mesurés. (Publication avec l’autorisation de Kris Poulsen et de Davide Foletti, Rinat Neuroscience
Corporation).

Module d'application Angiogenesis Tube Formation

Le module d’application Angiogenesis Tube Formation facilite l’analyse de la formation de tubes, un système expérimental modèle pour l’angiogenèse. La promotion ou l’inhibition de la formation de vaisseaux sanguins est un élément essentiel de la recherche sur le cancer, le diabète et d’autres maladies vasculaires. 

  • Capture le comportement tridimensionnel des tubes à l’aide de l’acquisition Z Stack disponible via le logiciel MetaXpress.
  • Une image du Z Stack avec mise au point optimale est analysée pour caractériser les tubes par surface, longueur, point de bifurcation et nodules.
Module d'application Angiogenesis Tube Formation
Formation de tubes de cellules épithéliales mammaires humaines (HMEC-1). (À gauche) Acquisition en
3D ; (au centre) l’algorithme de mise au point optimale réduit la série Z en une seule image ;
(à droite) les tubes et les nodules sont identifiés grâce au module d’application (données
fournies avec l’autorisation de BD Biosciences).

Module d’application Mitotic Index

Le module d’application Mitotic Index a été conçu pour la discrimination quantitative des cellules mitotiques et interphases, un outil essentiel des programmes de développement de médicaments pour l’oncologie, fournissant des connaissances sur des traitements potentiels anti-cancer qui s’appuient sur l’arrêt de la mitose des cellules cancéreuses pour prévenir la prolifération incontrôlée.

Module d’application Mitotic Index
(À gauche) Cellules CHO-K1 traitées au Nocodazole pendant 18 heures avant la coloration avec
un marqueur d’arrêt mitotique. (À droite) Après segmentation de l’image, le masque vert identifie
les cellules mitotiques et le masque rouge signale les noyaux en interphase.

Module d’application Cell Cycle

Le module d’application Cell Cycle classifie et quantifie les cellules à différents stades du cycle cellulaire afin d’étudier la progression du cycle. Dans les cellules non cancéreuses saines, les problèmes liés aux lésions de l’ADN, à l’hypoxie, aux modifications métaboliques ou à la perturbation du fuseau mitotique entraînent le déclenchement de points de contrôle et l’arrêt du cycle cellulaire. Les cellules cancéreuses perdent généralement leurs points de contrôle et se divisent de façon incontrôlée, même dans des conditions difficiles. Avec les outils appropriés, les chercheurs peuvent effectuer le criblage de médicaments entraînant l’arrêt du cycle cellulaire ou la mort cellulaire chez les cellules cancéreuses.

  • Différenciation des 5 phases du cycle cellulaire par un marquage nucléaire uniquement (G0/G1, S, G2, M précoce ou tardive).
  • Détection facultative de la mitose grâce à des fluorophores spécifiques pour mieux distinguer les cellules en phase M lors de l’utilisation d’un faible grossissement.
  • Détection facultative des marqueurs d’apoptose pour détecter les conditions qui déclenchent l’apoptose.
  • Grahiques interactifs à code couleur qui permettent de définir facilement les seuils de classification. 
Module d’application Cell Cycle
Classification et quantification des cellules dans 5 phases du cycle cellulaire. Graphiques interactifs à code couleur pour facilement définir les seuils de classification.

Module d’application Monopole Detection

Le module d’application Monopole Detection surveille la perturbation de la formation des fuseaux bipolaires, un mécanisme efficace utilisé par des médicaments tels que le monastrol pour stopper la progression des cellules cancéreuses via la mitose. Le module quantifie les cellules mitotiques présentant des fuseaux mitotiques monopolaires ou bipolaires dans les cellules marquées à l’aide d’une sonde d’ADN et d’une sonde de microtubule.

Module d’application Monopole Detection
(À gauche) Cellules de fibroblastes de souris 3T3-L1 traitées au monastrol et colorées pour la tubuline bêta.
Les noyaux sont marqués par des colorants Hoechst. (À droite) Le module identifie les cellules d’interphase (rouge), les fuseaux mitotiques bipolaires (bleu) et les monopoles (vert).

Module d’application Cell Scoring

Le module d’application Cell Scoring est une solution générale et polyvalente permettant d’identifier des sous-populations de cellules taguées à l’aide d’une seconde sonde fluorescente. Cette solution est idéale pour l’examen des efficacités de transfection, d'activation de voie (kinases) ou de l’adipogenèse.

  • Étiquetage de toutes les cellules nucléées ou entières ; seules les cellules d’intérêt présenteront la coloration de la cible avec un second fluorophore
  • Identification robuste des cellules affichant des marqueurs de lésions de l’ADN, de différentiation ou d’une autre activation sélective
  • Précision identique avec un grossissement faible ou fort
  • Résultats présentés sous forme de nombre ou de pourcentage positif ou négatif, ou incluant les valeurs d’intensité de fluorescence de chaque cellule, ou en tant que total ou moyenne du champ.
Module d’application Cell Scoring
(En haut, à gauche) Cellules HeLa marquées avec DAPI. (En bas, à gauche) Immunomarquage pour marqueur cible.
(En haut, au centre) La quantification en 3 couleurs identifie tous les noyaux (en rouge). (En bas, au centre) Le module d’application Cell Scoring identifie l’immunomarquage positif. (À droite) La superposition montre les cellules positives pour le marqueur (vert) et négatives pour le marqueur (rouge). 

Module d’application Multi-Wavelength Cell Scoring

Le Module d’application Multi-Wavelength Cell Scoring améliore les fonctionnalités du module d’application Cell Scoring afin d’inclure des longueurs d’ondes supplémentaires pour noter les populations de cellules en fonction d'un grand nombre d'étiquettes.

  • Il est possible d’analyser simultanément jusqu’à sept longueurs d’ondes fluorescentes afin de personnaliser l’analyse pour de nombreux marqueurs (ou pour analyser le même marqueur avec différents réglages).
  • Les zones marquées peuvent être définies en tant que noyau, cytoplasme ou cellule entière pour une meilleure segmentation.

Module d’application Multi-Wavelength Cell Scoring

Modules d’application Count Nuclei et Cell Proliferation HT

Les modules d’application Count Nuclei et Cell Proliferation HT automatisent le comptage précis des noyaux de la plupart des types de cellules et conviennent particulièrement à l’étude de la prolifération cellulaire, du comptage des cellules ou de la migration cellulaire. Ces modules comptent les noyaux, même lorsque le bruit de fond est inégal, et fournissent une segmentation supérieure à celle obtenue avec un simple seuillage.

  • Ces deux modules identifient les noyaux en tenant compte de la taille du noyau et de l’intensité variable du bruit de fond.
    • Les objets qui se touchent sont automatiquement séparés.
    • Plus de cohérence d’un utilisateur à un autre et plus rapide que le comptage manuel.
    • Plus facile et plus rapide que la cytométrie en flux qui est une méthode à bas débit nécessitant une trypsinisation des cellules.
  • Le module d’application Cell Proliferation HT est une version à haut débit du module d’application Count Nuclei (environ 1 minute pour une plaque de 96 puits sur un site par puits sans le logiciel MetaXpress® PowerCore™) dotée d’un algorithme de détection simplifié, lequel fournit uniquement des données résumées sur le site (et non cellule par cellule) et n’enregistre pas les superpositions de segmentation dans la base de données MDCStore.
Modules d’application Count Nuclei et Cell Proliferation Ht
(À gauche) L'image présente un éclairage inégal et des cellules qui se touchent. (À droite) Le module
identifie les cellules qui se touchent en tant qu’objets distincts (comme l’indique la flèche rouge).
La fonctionnalité Adaptive Background Correction compense l’intensité variable du bruit de fond,
même lorsque l’intensité du bruit de fond dans une zone de l’image est supérieure à l’intensité
des noyaux dans une autre zone.

Module d’application Cell Health

Le module d’application Cell Health classifie les cellules selon leur état, à savoir viable, apoptose précoce, apoptose tardive ou nécrose.

  • 3 longueurs d’ondes de détection des marqueurs nucléaires ou cytoplasmiques 
  • Cellules classées en tant que viables, nécrotiques, en apoptose précoce ou tardive en fonction de l’intensité des marqueurs
  • Données champ par champ, y compris les quantités, pourcentages, surface et intensité totales et moyennes
  • Données cellule par cellule, y compris l’état de santé et les mesures de surface et d’intensité
  • Validé à l’aide des colorants les plus courants permettant d’évaluer la santé cellulaire, tels que Yo-Pro 1, Annexine V ou CellEvent Caspase 3/7 pour l’apoptose, l’iodure de propidium pour la nécrose ou des colorants de mitotoxicité tels que JC-1 ou JC-10 pour étudier la perte de potentiel mitochondrial
Module d’application Cell Health
(À gauche) Les cellules ont été traitées à l’aide de 1 μM de staurosporine pendant 12 heures et colorées
à l’aide de Hoechst 33342, YO-PRO-1 et PI ; (à droite) les résultats de l’analyse d’image sont présentés
sous la forme d’une superposition colorée sur l’image source. Les noyaux viables sont affichés en vert. Les noyaux en apoptose précoce sont affichés en bleu. Les noyaux en apoptose tardive sont affichés en violet.
Les noyaux nécrotiques sont affichés en rouge.

Module d’application Live/Dead

Le module d’application Live Dead est compatible avec les kits de test Live/Dead commercialisés et conçus pour étudier la prolifération ou la mort cellulaire. Les applications courantes surveillent la prolifération cellulaire associée au cancer ou la mort cellulaire causée par des maladies neuromusculaires telles que la maladie d’Alzheimer et la maladie de Parkinson, ou en réponse à des événements cytotoxiques ou d’apoptose.

  • 2 longueurs d’ondes présentes dans n'importe quelle partie de la cellule, pas nécessairement dans le noyau
  • Classe les cellules en tant que vivantes ou mortes en fonction de l’intensité des marqueurs
  • Données champ par champ, y compris les quantités, pourcentages, surface et intensité totales et moyennes
  • Données cellule par cellule, y compris la classification et les mesures de surface et d’intensité
Module d’application Live/Dead
(À gauche) Les cellules ont été traitées avec 1 µM de staurosporine. (À droite) Les objets rouges
correspondent à des cellules vivantes, et les objets verts à des cellules mortes.

Modules d’application Granularity, Transfluor et Transfluor HT

Les modules d’application Granularity, Transfluor et Transfluor HT facilitent l’analyse des structures punctiformes telles que celles observées lors du regroupement des molécules cibles pour l’internalisation du récepteur, ou dans le noyau, ou même les modèles punctiformes des mitochondries ou autres organites.

  • 1 à 2 longueurs d’ondes (marquage d’intérêt pour les structures punctiformes, marquage nucléaire facultatif)
  • Le module Transfluor Application détecte simultanément les petits puits et les grandes vésicules dans la même longueur d’onde. Il est optimisé pour le test GPCR universel au transfluor.
  • Le module d’application Transfluor HT est une version à haut débit du module d’application Granularity pour le criblage rapide (environ 1 minute pour une plaque de 96 puits sur un site par puits sans le logiciel MetaXpress PowerCore) dotée d’un algorithme de détection simplifié, lequel fournit uniquement des données résumées sur le site (et non cellule par cellule) et n’enregistre pas les superpositions de segmentation dans la base de données MDCStore.
Modules d’application Granularity, Transfluor
Cellules U2OS (à gauche), superposition (à droite). Ce module identifie les granules et les noyaux, même dans les cellules avec bruit de fond élevé (flèche rouge).
Modules d'application MetaXpress Transfluor HT
(À gauche) La phagocytose est détectée en incorporant un anticorps marqué en vert
par fluorescence. Les cellules sont détectées à l’aide d’un colorant nucléaire bleu. (À droite)
Le module identifie les noyaux en bleu et les structures phagocytaires en rouge.

Modules d’application Translocation, Translocation-Enhanced, Multi-Wavelength Translocation et Nuclear Translocation HT

Les modules d’application Translocation, Translocation-Enhanced, Multi-Wavelength Translocation et Nuclear Translocation HT quantifient la corrélation entre les sondes et les compartiments grâce à quatre modules disponibles afin de répondre à vos besoins.

  • Le module d’application Translocation convient parfaitement à l’étude générale du mouvement des composants cellulaires du cytoplasme vers le noyau avec un nombre minimal de réglages.
  • Le module d’application Translocation-Enhanced propose des fonctionnalités améliorées par rapport au module d’application Translocation grâce à une définition plus fine des régions de translocation et à la possibilité d’étudier la translocation dans des compartiments non nucléaires tels que les mitochondries.
  • Le module d’application Nuclear Translocation HT est destiné à l’analyse rapide de la translocation vers et depuis le compartiment nucléaire (environ 1 minute pour une plaque de 96 puits sur un site par puits sans le logiciel MetaXpress PowerCore) grâce à un algorithme de détection simplifié, lequel fournit uniquement des données résumées sur le site (et non cellule par cellule) et n’enregistre pas les superpositions de segmentation dans la base de données MDCStore.
  • Le module d’application Multi-Wavelength Translocation permet d’analyser simultanément la translocation de jusqu'à 6 sondes (ou des mêmes sondes avec des paramètres variés), en plus du marquage nucléaire.
MetaXpress Transfluor HT
(À gauche) Aucune translocation d’une sonde rouge du cytoplasme vers le noyau n’est visible.
(Au centre) La translocation est visible dans la cellule du centre. (À droite) La couleur verte
indique que la cellule est positive pour la translocation.
Test de translocation nucléaire MetaXpress
Test de translocation nucléaire. (À gauche) Facteur de transcription détecté à l’aide d’une sonde verte.
(Au centre) Les noyaux sont détectés à l’aide d’un colorant bleu. (À droite) Le module d’application Nuclear Translocation HT détecte la corrélation entre les 2 longueurs d’ondes et la couleur de la superposition
indique si la corrélation se situe au-dessus (rouge) ou en dessous (vert) d’un seuil de corrélation défini par l’utilisateur.

Il est possible de rédiger rapidement des modules personnalisés et flexibles pour des analyses avancées, comme l’identification d’objets au sein d’objets, la création de classificateurs morphométriques pour l’analyse de la forme, et l’analyse à la fois de la couleur et des images obtenues en lumière transmise. L’éditeur de module personnalisé, disponible dans le logiciel MetaXpress version 5 et ultérieure, est un environnement interactif flexible dans lequel les utilisateurs peuvent créer et tester un modèle d’analyse d’image.

Modules personnalisés flexibles du logiciel MetaXpress
Les modules personnalisés du logiciel MetaXpress peuvent localiser des objets se trouvant dans
des compartiments cellulaires spécifiques, tels que des éléments punctiformes dans des excroissances de neurites. La superposition de segmentation
montre : jaune : neurites ; points bleu sombre : peptides synaptiques ; rose : noyaux.
Les noyaux non neuronaux sont exclus de l’analyse. 
Il est possible de créer de puissantes macros de journal pour l’exécution sans surveillance de routines complexes à plusieurs étapes incluant n’importe quel contrôle de matériel et analyse d’image.

Pour obtenir plus d’informations sur les configurations et le prix d’un produit, veuillez demander un devis ou nous contacter.

Conçu pour cribler 1 million d’échantillons en à peine 2 semaines, le logiciel MetaXpress PowerCore exploite la puissance du traitement parallèle pour accélérer l’analyse d'image tout en préservant la qualité de la segmentation de l’image et les nombreuses sorties souhaitées pour une analyse multiparamétrique.

Le traitement parallèle supprime les goulots d’étranglement dans l’analyse d'image.

  • Plateforme serveur-client avec serveur qui divise l’analyse des plaques en processus de petite taille et les distribue auprès de plusieurs clients. Chaque client, qui s’exécute sur des ordinateurs à plusieurs processeurs, effectue l’analyse et transmet les résultats au serveur.
  • La conception évolutive permet d’ajouter des processeurs si un débit d’analyse supérieur est requis.
  • Intégration au flux de travail de criblage haut contenu : à la fin de l’analyse, le serveur enregistre efficacement toutes les données dans le gestionnaire de données MDCStore™. Il est ainsi possible d’accéder aux résultats dans un laboratoire ou dans l’ensemble d’une organisation.
Protocole HCS - Logiciel Metaxpress Powercore
Le logiciel MetaXpress PowerCore accélère la séquence de travail HCS en réduisant notablement le temps nécessaire à l’analyse d'image. Le logiciel MetaXpress PowerCore est une solution serveur-client qui exploite
la puissance du traitement parallèle pour permettre aux utilisateurs d’utiliser un nombre évolutif de processeurs, basé sur client, pour exécuter les algorithmes du module d’application du logiciel MetaXpress
en parallèle, ce qui augmente de 5 à 40 fois la vitesse d’analyse.
Les configurations de base permettent aux laboratoires de recherche et de criblage mineur d’analyser les plaques au même rythme que l’acquisition d’image. L’octroi évolutif de licences permet d’adapter la vitesse d’analyse aux besoins de votre laboratoire (nombre d’instruments pris en charge, volume de données généré et complexité de vos fichiers de données multiparamétriques).

Les configurations avancées conviennent idéalement aux sites principaux ou aux environnements d’imagerie à haut débit et permettent d’accélérer le module d’application jusqu’à une vitesse 25 fois supérieure à celle de l’acquisition. Grâce à cette vitesse, il est possible d’exécuter plusieurs systèmes ImageXpress en parallèle au maximum de leurs capacités ou de réanalyser en quelques minutes des images archivées.

Analyse de microplaques de 384 puits - Logiciel MetaXpress PowerCore
Temps d’analyse des images par plaque de 384 puits quand le logiciel MetaXpress PowerCore est utilisé.
Ces résultats ont été obtenus sur des ordinateurs respectant les caractéristiques et les exigences informatiques recommandées.
 

La solution de gestion des données MDCStore organise les images et les informations expérimentales générées par plusieurs instruments d’imagerie, ainsi que les données provenant de l’analyse des images, de l’analyse des données ou du logiciel de visualisation, ce qui permet une manipulation intégrée d’ensembles complexes d’images et de métadonnées.

  • La conception évolutive garantit la disponibilité d’une quantité appropriée de stockage d’images et de métadonnées pour prendre en charge les exigences croissantes du laboratoire, les nombreux utilisateurs ou la récupération des données pendant l’acquisition de l’image.
  • Le schéma de base de données MDCStore est disponible aussi bien pour Microsoft SQL Server que comme outil compatible Oracle ; celui-ci peut être intégralement déployé par votre équipe d’administration de base de données.
  • De nombreuses options de stockage peuvent être personnalisées pour répondre aux besoins d'environnements comportant plusieurs utilisateurs, comme c’est le cas des laboratoires principaux.

Consultez les caractéristiques recommandées de l’ordinateur et du serveur pour le criblage haut contenu. 

MDCStoreTools est un utilitaire autonome qui aide les administrateurs de base de données ou les services informatiques à gérer la solution de gestion des données MDCStore.

  • Active la configuration des utilisateurs, groupes et sites de stockage d’images dans des environnements comportant de nombreux utilisateurs tels que les laboratoires principaux.
  • Il est possible de définir des politiques de sécurité pour Microsoft SQL Server ou pour Oracle afin d'assurer un accès restreint aux groupes et aux utilisateurs.
  • Optimisation, développement ou réduction de la base de données pour garantir la sécurité maximale des données et performances pouvant être affinées par la suite afin de répondre à l’évolution de vos besoins en stockage HCS.
  • Gestion des images et des données pour l’archivage, la sauvegarde/restauration (serveur SQL uniquement) d’anciennes données, l’association ou la séparation de bases de données (serveur SQL uniquement), la migration de données vers des sites de stockage d'images étiquetées, ou la suppression sélective de données (toutes les images ou uniquement la segmentation d’image).

Le kit de développement logiciel (SDK) MDCStore met à disposition des outils permettant d’accéder à et d'échanger des données avec des solutions tierces.

  • Interface de programme d’application (API) permettant d’échanger des emplacements d’images, des données et des métadonnées avec un logiciel tiers afin de faciliter la communication avec les systèmes de gestion des informations de laboratoire (LIMS), de fournir d’autres méthodes d’analyse et de visualisation des données ou d'analyser des images de tiers dans la solution de gestion des données MDCStore.
  • Octroi facile de licence pour permettre aux utilisateurs de développer leurs propres applications non commerciales internes en vue de leur intégration à des bases de données d’entreprise et des applications tierces. Des licences commerciales et de distribution sont également disponibles.

Nombre de citations* : 765

Dernières citations :
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Brief Report: Isogenic Induced Pluripotent Stem Cell Lines From an Adult With Mosaic Down Syndrome Model Accelerated Neuronal Ageing and …

A Murray, A Letourneau, C Canzonetta, E Stathaki… - Stem …, 2015 - Wiley Online Library
... Image capture and quantification were performed using automated multiparametric
analysis on the ImageXpress Micro XL (Molecular Devices) wide-field high content
imaging system, and data were analyzed using MetaMorph software. ...

cAMP and EPAC Signaling Functionally Replace OCT4 During Induced Pluripotent Stem Cell Reprogramming

AL Fritz, MM Adil, SR Mao, DV Schaffer - Molecular Therapy, 2015 - nature.com
... The wells were imaged with the ImageXpress Micro (Molecular Devices) and analyzed with
MetaXpress software. ... The SOX2 and EdU staining was imaged with the ImageXpress Micro
(Molecular Devices) and analyzed with MetaXpress software. Quantitative RT-PCR. ...

A genome-wide RNAi screening method to discover novel genes involved in virus infection

D Panda, S Cherry - Methods, 2015 - Elsevier
... Plate sealing adhesive film. 2.1.5. Automated imaging and image processing.
ImageXpress Micro (Molecular Devices). Metaxpress software (Molecular Devices).
2.2. Acquiring images using the ImageXpress Micro and image analysis. ...

Triphenyl phosphate-induced developmental toxicity in zebrafish: Potential role of the retinoic acid receptor

GM Isales, RA Hipszer, TD Raftery, A Chen… - Aquatic Toxicology, 2015 - Elsevier
... Micro system was maintained between 25 and 27 °C by removing panels on both sides of the
ImageXpress Micro system and blowing air from left to right through the ImageXpress Micro with
... Within MetaXpress 4.0.0.24 software (Molecular Devices, Sunnyvale, CA, USA ...
 

High Throughput Characterization of Adult Stem Cells Engineered for Delivery of Therapeutic Factors for Neuroprotective Strategies

AD SharmaPA Brodskiy, EM Petersen… - JoVE (Journal of …, 2015 - jove.com
... Equine serum, Hyclone (Logan, UT), SH3007403, ImageXpress MicroMolecular devices
(Sunnyvale, CA), ImageXpress micro, High content screening system. MetaXpress 4.0, Molecular
devices (Sunnyvale, CA), MetaXpress 4.0, Image acquisition and analysis software. References ...
 
 

A Genome-Wide siRNA Screen in Mammalian Cells for Regulators of S6 Phosphorylation

A Papageorgiou, J Rapley, JP Mesirov, P Tamayo… - PloS one, 2015 - ncbi.nlm.nih.gov
... cells were imaged on the High Content automated Imaging microscope ImageXpress Micro
System (IXM) (Molecular Devices, http://www.moleculardevices.com) at 10X magnification (Fig.
1) and analyzed using the MetaXpress software program (Molecular Devices Inc). ...

Chemical analysis of Karenia papilionacea

N Fowler, C Tomas, D Baden, L Campbell… - Toxicon, 2015 - Elsevier
... plate was then returned to the 37 °C incubator for 30 min before imaging on an Image Xpress
Micro system equipped ... Cytotoxicity of each fraction was determined using the ImageXpress Micro
(Molecular Devices, Sunnyvale, CA) using the multi-wavelength cell scoring macro. ...
 

Copper improves the anti-angiogenic activity of disulfiram through the EGFR/Src/VEGF pathway in gliomas

Y Li, SY Fu, LH Wang, FY Wang, NN Wang, Q Cao… - Cancer Letters, 2015 - Elsevier
... After 3 days, microvessel growth was measured by taking photographs with an
ImageXpress-Micro high content system (magnification, ×100). The number of microvessel
sprouts was measured using MetaXpress software (Molecular Devices). ...

Quantitative Analysis of Transferrin Cycling by Automated Fluorescence Microscopy

DT Hirschmann, CA Kasper, M Spiess - Membrane Trafficking: Second …, 2015 - Springer
... an automated wide-field screening microscope, such as the ImageXpress Micro System (Molecular
Devices). The setup used here consists of the following components: 1. ImageXpress Micro
automated cellular ... 5. MetaXpress software controlling all components of the system. ...
 

Insect-Derived Cecropins Display Activity against Acinetobacter baumannii in a Whole-Animal High-Throughput Caenorhabditis elegans Model

E JayamaniR Rajamuthiah… - Antimicrobial agents …, 2015 - Am Soc Microbiol
... The worms were then incubated overnight at 25°C. Stained plates were imaged with a Molecular
Devices ImageXpress Micro (Molecular Devices, Sunnyvale, MA) automated microscope with
bright-field and tetramethyl rhodamine isothiocyanate (TRITC) channels (Fig. ...
fdkfdkdl;f

* au 13 août 2015. Source : Google Scholar. Les résultats de la recherche incluent « ImageXpress Micro » et « MetaXpress ».