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Acquisition ciblée d’images QuickID

Acquisition ciblée QuickID

 

L’acquisition ciblée QuickID fonctionne en faisant l’acquisition du champ de vision (FoV) complet d’un échantillon sous un faible grossissement, détecte les objets d’intérêt ou les événements rares grâce à un processus rapide d’analyse d'image, puis fait à nouveau l’acquisition de ces puits ou sites sous un grossissement élevé et avec un protocole configuré par l’utilisateur pouvant inclure les longueurs d’onde, les Z Stack et les points de capture dans le temps pertinents.

L’acquisition ciblée des images est réalisée par le logiciel MetaXpress et peut être utilisée avec les systèmes ImageXpress Micro 4 et ImageXpress Micro Confocal

ciblée quickID

 

Augmentez le rendement de l’imagerie en utilisant l’acquisition ciblée QuickID

 

Les chercheurs réalisant un criblage à haut contenu sur image peuvent faire face à diverses difficultés techniques s’ils doivent évaluer leurs échantillons par imagerie avec une haute résolution et plusieurs longueurs d’onde et sur un grand nombre de plans Z. Ces tests impliquent souvent de longs temps d’acquisition, de plusieurs heures à deux jours, un grand espace de stockage des images, des centaines de Go, et des niveaux de puissance de calcul élevées pour que le temps d’analyse des images soit acceptable, quelques heures étant préférable.

Une façon simple de minimiser toutes ces difficultés est de ne faire l’acquisition que des champs de vision, sur la lame ou dans la microplaque, qui contiennent des objets d’intérêt. Cette technique peut se révéler particulièrement utile lorsque l’objet d’intérêt est très peu abondant dans chaque échantillon, qu'il est réparti de manière aléatoire dans l’espace ou qu’il n'apparaît que rarement dans une partie des micropuits. Cette solution, lorsqu’elle est utilisée avec nos systèmes d’imagerie à haut contenu et notre logiciel d’analyse d’images, réduit significativement le temps d’obtention des résultats et les besoins de stockage des images.

 

Acquisition des données 10 fois plus rapide à partir de cultures cellulaires 3D

Dans la note d’application « Acquisition des données 10 fois plus rapide à partir de sphéroïdes 3D en utilisant Symphony® et VersaGel® », un hydrogel réticulable léger a été utilisé comme matrice pour mettre en culture de 1 à 4 sphéroïdes par puits dans un espace en 3 dimensions. Après le marquage, QuickID a été exécuté en utilisant un objectif 2x pour capturer l’intégralité du puits dans un seul champ. Les objets d’intérêt ont été identifiés et leurs coordonnées X et Y ont été automatiquement référencées afin que le système ImageXpress Micro n’obtienne que les images pertinentes sous un grossissement 10x dans trois longueurs d’onde sur plusieurs plans Z. Avec QuickID, le temps d’acquisition a été 10 fois plus rapide que l’imagerie de tous les sites dans chaque puits avec un fort grossissement et cela divise également par 20 l’espace de stockage requis.

 

cultures cellulaires 3D

 

QuickID a été utilisé pour optimiser l’acquisition des images des sphéroïdes Une image acquise sous un faible grossissement pour visualiser l’intégralité du puits dans un champ a été utilisée pour identifier les objets pour la nouvelle imagerie automatique sous un grossissement plus fort en utilisant trois longueurs d’onde sur plusieurs plans Z.

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Imagerie automatique des sphéroïdes 3D au centre du champ

Il existe plusieurs méthodes pour la mise en culture des sphéroïdes pour le criblage des médicaments antitumoraux. Dans certains formats, les sphéroïdes ne sont pas toujours centrés dans le puits, ce qui complique l’acquisition de l’objet d’intérêt dans un seul champ de vision (CdV) sous un fort grossissement. QuickID nous a permis de faire l’imagerie automatique de chaque sphéroïde au centre du CdV en utilisant un objectif à immersion dans l’eau 20x pour recueillir les Z Stack à plusieurs longueurs d’onde sans faire l’acquisition de sites supplémentaires.

Cible QuickID

QuickID a été exécuté avec un objectif 10x afin d'accélérer l’imagerie d’une microplaque entière. Les objets sphériques ont alors été identifiés et leurs coordonnées X et Y ont été utilisées pour faire uniquement l’acquisition automatique des sites contenant un microtissu tumoral avec un objectif à immersion dans l’eau 20x à plusieurs longueurs d’onde et plans Z. L’analyse des images a été réalisée afin de détecter et de mesurer les objets dans le volume 3D.

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Autres applications de l’acquisition ciblée

QuickID optimise le processus afin que seules les images pertinentes soient acquises, ce qui permet d’économiser beaucoup de temps et de réduire les exigences en matière de stockage. Exemples d’autres domaines d’application qui peuvent bénéficier de l’utilisation de QuickID : imagerie en temps réel de la division des cellules ou des organismes modèles, et imagerie de zones spécifiques de coupes de tissu sur une lame.

 

  • Fuseau mitotique

    Fuseau mitotique

    Dans une population de cellules normales, seulement de 1 à 5 % des cellules sont en mitose. L’acquisition ciblée peut être utilisée pour identifier ces cellules dans toute la population, puis les suivre dans le temps sous un fort grossissement. Il est possible de suivre et de recentrer les cellules si elles sortent d’une région pendant l’acquisition.

    Micro-sphéroïdes 3D

    Micro-sphéroïdes 3D

    Des micro-sphéroïdes s’accumulent souvent sur le bord des plaques à fond plat. Une acquisition à lumière transmise initiale suivie d’une acquisition Z Stack ciblée des marqueurs fluorescents peut être réalisée afin de réduire significativement le nombre d’images requises.

  • Hippocampe dans une coupe de cerveau

    Hippocampe dans une coupe de cerveau

    Selon la morphologie de l’échantillon et sa préparation, l’hippocampe et d’autres parties du cerveau pourraient se retrouver dans diverses zones d’une lame. L’acquisition Z Stack ciblée peut être réalisée à plusieurs longueurs d’onde pour étudier la co-localisation.

    Pulsations cardiaques chez un poisson-zèbre

    Pulsations cardiaques chez un poisson-zèbre

    La position et l’orientation d’un poisson-zèbre dans un puits peuvent varier. L’acquisition en accéléré ou le Z Stack sous un fort grossissement du cœur, des yeux, du cerveau, du sac vitellin, des iridophores ou des vaisseaux sanguins peut être réalisée en utilisant l’acquisition ciblée.

  • Micronoyaux

    Micronoyaux

    Sous un faible grossissement, il est difficile de déterminer avec précision si un objet est réellement un micronoyau ou simplement un artefact. La ré-acquisition ciblée sous un fort grossissement peut permettre de réduire le nombre de faux positifs.

Ressources sur l’acquisition ciblée d’images QuickID

Produits associés à l’acquisition ciblée d’images QuickID