Automatisation de votre flux de travail de biologie de synthèse
Automatisez votre flux de travail manuel de biologie de synthèse avec QPix
Les applications de biologie de synthèse haut débit telles que l’ingénierie de souches bénéficieront grandement de la productivité accrue d’un système robotisé de sélection de colonies microbiennes tel que notre système de sélection de colonies microbiennes QPix, qui sélectionne jusqu’à 30 000 colonies par jour grâce au suivi automatique des données des séries de sélection et à la gestion de la base de données. Le système QPix peut être intégré dans un flux de travail moléculaire complet, ce qui vous assure un débit plus élevé et une durée d’autonomie allongée et vous permet de vous concentrer davantage sur la composante d’apprentissage de l’approche DBTL, pour éclairer les conceptions ultérieures de nouvelles souches.
Flux de travail : Biologie de synthèse avec QPix
- Étalement : il s’agit de l’étape initiale de la recherche en biologie de synthèse. Les cellules microbiennes ou les concepts génétiques sont étalés sur des plaques d’agar solide pour former des colonies individuelles. Pour optimiser le processus, il est possible d’utiliser des systèmes automatisés tels que des ensemenceurs de colonie robotisés. Ces systèmes utilisent des techniques d’étalement haute densité, permettant l’ensemencement simultané de nombreux échantillons de manière précise et efficace. Cette automatisation fait gagner du temps et réduit le risque d’erreur humaine, ce qui vous permet d’ensemencer un plus grand nombre d’échantillons en moins de temps.
- Criblage : après l’ensemencement, l’étape suivante consiste à cribler les colonies pour identifier celles présentant un intérêt. Cette étape est traditionnellement réalisée manuellement ; vous inspectez visuellement et sélectionnez les colonies en fonction de certaines caractéristiques. Toutefois, pour améliorer le débit, les systèmes de criblage automatisé des colonies sont de plus en plus répandus. Ces systèmes utilisent des algorithmes d’analyse d’images et d’apprentissage automatique (machine learning) pour identifier et catégoriser rapidement les colonies selon des critères prédéfinis. L’automatisation de ce processus permet de cribler rapidement un grand nombre de colonies, pour gagner du temps et réduire la subjectivité.
- Sélection : une fois les colonies d’intérêt identifiées, commence le processus de sélection. Cette étape repose traditionnellement sur des techniques manuelles, comme l’utilisation d’embouts de pipette stériles, de cure-dents ou d’anses d’inoculation. Cependant, l’utilisation de systèmes automatisés de sélection de colonies accroît le débit. Ces systèmes perfectionnés utilisent des bras robotisés avec des pointes ou des aiguilles fines pour transférer rapidement et précisément les colonies sélectionnées dans diverses applications en aval. Les systèmes automatisés de sélection de colonies peuvent traiter un grand nombre d’échantillons par heure, ce qui augmente considérablement le débit et réduit les tâches laborieuses.
- Certains bénéfices du repiquage automatisé des colonies pour la biologie de synthèse:
- Améliore le débit tout en réduisant les opérations manuelles
- Permet un repiquage de colonies objectif et régulier plutôt qu’un repiquage manuel subjectif
- Convient à un grand nombre d’applications différentes
- Le suivi électronique des données permet un contrôle des données bien documenté
- Réplication : étape cruciale dans la recherche en biologie de synthèse, la réplication des colonies sélectionnées permet la préservation et la distribution du matériel génétique pour l’analyse et l’expérimentation ultérieures. La réplication manuelle implique l’inoculation en stries de colonies sur plusieurs plaques, ce qui peut être fastidieux et propice à l’erreur humaine. Utilisez des systèmes automatisés de réplication des colonies pour optimiser ce processus. Ces systèmes utilisent la robotique et des techniques d’étalement haute densité pour répliquer simultanément les colonies sur plusieurs plaques, en veillant à la régularité et l’efficacité.
- Réarrangement : le réarrangement implique le transfert des colonies depuis leurs plaques d’origine vers de nouveaux formats ou récipients pour le stockage à long terme ou des expériences complémentaires. Cette étape est essentielle pour maintenir de vastes collections de ressources génétiques et pour faciliter les flux de travail haut débit. Les systèmes automatisés de réarrangement, tels que les systèmes robotisés de sélection de colonies avec lecteurs de codes-barres et capacités de manipulation de liquides, peuvent transférer avec précision et efficacité les colonies vers différents formats, tels que les microplaques ou les tubes de stockage. En automatisant le réarrangement, vous pouvez obtenir des processus de transfert standardisés et sans erreurs, pour une meilleure organisation et accessibilité des ressources génétiques.