L’Université d’Édimbourg utilise des systèmes de repiquage de colonies QPix pour accroître sa production d’ADN

Le défi

L’Edinburgh Genome Foundry (EGF) fabrique du matériel génétique pour ses clients en utilisant une plateforme robotique totalement automatisée, créant et modifiant des brins d’ADN pouvant atteindre des longueurs jusqu’à un méga de paires de base. Ces constructions d’ADN sont utilisées pour équiper les cellules ou les organismes entiers d’une nouvelle fonctionnalité ou d’une fonctionnalité améliorée, par exemple dans le cadre de la programmation de cellules souches en médecine personnalisée, la production de bactéries détectrices de maladie ou l’augmentation du rendement de cultures pour biocarburants.

Pour atteindre un débit d’échantillons plus élevé avec un suivi précis des échantillons et des données, EGF avait besoin d’un système automatisé de repiquage des colonies ayant la capacité d’étaler et d’ensemencer plusieurs échantillons sur des plateaux au format SBS compatibles avec l’automatisation. En outre, ce système devait être entièrement intégrable au flux de travail automatisé existant. Pour cela, des modifications matérielles et logicielles étaient nécessaires afin d'assurer l’accès à des bras robotisés tiers pour la manipulation et la distribution des échantillons vers d’autres instruments dans le flux de travail.

La solution

Systèmes de sélection de colonies microbiennes QPix

Détails

Produits utilisés

Les systèmes de repiquage de colonies microbiennes QPix 400 Series sont les seuls qui vous permettent de procéder, de manière simultanée, à la détection de colonies et à la quantification de marqueurs fluorescents lors d'une étape de pré-analyse précédant le repiquage. Nos systèmes QPix sont utilisés de par le monde dans plus de 600 installations au sein d'instituts de recherche, de sites de séquençage, d'entreprises pharmaceutiques et de biotechnologies. Depuis le projet Génome Humain, les robots QPix jouissent d'une solide réputation de fiabilité et de précision au sein des centres de séquençage.

Plus que de simples instruments de repiquage de colonies, ils vous permettent de :

• Automatiser les protocoles depuis l'échantillonnage et l'étalement jusqu’au repiquage
• Repiquer les bonnes colonies à tout moment
• Gérer efficacement de grandes et diverses populations  pour : l'expression de protéines, la recherche en biocarburants, l'évolutione enzymatique,le phagedisplay le séquençage d'ADN, la création et la gestion de banques

Demander un devis pour ce système

Les résultats

Avec la capacité d’étaler jusqu’à 200  échantillons ou de repiquer jusqu’à 3 000 colonies par heure, le système QPix Select-HT permet l’échantillonnage haut débit nécessaire pour une livraison rapide à leurs clients. Chaque processus bénéficie d’un suivi fiable des échantillons et d’une gestion des données, ce qui permet à l’EGF de gérer efficacement les données d’échantillons pour l’intégralité du flux de travail automatisé. L’intégration du système dans un flux de travail totalement automatisé réduit également les heures de travail nécessaires, et diminue ainsi les coûts pour chaque projet de l’EGF. L’étroite collaboration entre l’équipe AWES de Molecular Devices et l’Edinburgh Genome Foundry a abouti à une solution efficace pour les besoins spécifiques de leur flux de travail, permettant à l’EGF d’atteindre leur objectif de plateforme totalement automatisée pour l’assemblage d’ADN.

Télécharger l’étude de cas complète (version PDF)

Voir le QPix en action à la Genome Foundry d’Édimbourg

https://share.vidyard.com/watch/kVYfXTZ2tpo2cTJ3FAazqn

Références

Wevers, N.R. et al. High-throughput compound evaluation on 3D networks of neurons and glia in a microfluidic platform. Nature Scientific Reports 6, ; numéro d’article : 38856 (2016).

Junaida A. et al. An End-User Perspective on Organ-on-a-Chip: Assays and Usability Aspects. Current Opinion in Biomedical Engineering. Article in Press (2017).