Marquage cellulaire

Noyau
Colorant : Hoechst 33342

Mitochondrie
Colorant : Rouge profond MitoTracker

Réticulum endoplasmique
Colorant : Conjugué Concanavalin A/Alexa Fluor 488

ARN cytoplasmique, nucléoles
Colorant : SYT0 14 colorant fluorescent vert pour acide nucléique

Cytosquelette de F-actine, appareil de Golgi, membrane plasmatique
Colorant : Conjugué Phalloïdine/Alexa Fluor 568, conjugué agglutinine de germe de blé/Alexa Fluor 555
 

Image composite à partir d’actine, de RE (réticulum endoplasmique) et des noyaux

Marquage cellulaire pour le profilage phénotypique

Le profil phénotypique d’une cellule révèle l’état biologique spécifique d’une cellule. Plus spécifiquement, il peut être utilisé pour interroger des perturbations biologiques car la morphologie cellulaire est influencée par des facteurs tels que le métabolisme, l’état génétique et épigénétique de la cellule, et des facteurs environnementaux. En outre, il peut être utilisé pour caractériser des cellules saines par rapport à des cellules malades. Comme un profil phénotypique est une agrégation d’un grand nombre de mesures, il est plus sensible aux écarts ou aux variations des caractéristiques extraites du test de marquage cellulaire. En d’autres termes, un profil phénotypique peut capturer certaines caractéristiques des cellules qui peuvent ne pas être évidentes à l’œil nu.

Dans un entretien avec leScience explorer, Angeline Lim, PhD., explique : « J’aime penser que le marquage cellulaire ou le profilage phénotypique est semblable à la reconnaissance faciale. C’est un peu comme le taguage des gens par Facebook ou iPhoto. Lorsque vous avez une photographie et que vous la taguez, le logiciel en arrière-plan extrait des informations relatives à la photo et calcule un profil. Lorsqu’une autre photo apparaît, le logiciel compare son profil à celui de la photo précédente pour voir s’ils sont identiques ou différents. C’est en fait comme cela que le marquage cellulaire fonctionne. Avec le marquage cellulaire, nous espérons que l’analyse d’images regroupe les cellules semblables par rapport aux cellules différentes, ou les cellules malades par rapport aux cellules saines. Cela peut potentiellement intéresser de nombreuses applications, tout particulièrement dans le domaine de la découverte de médicaments. »

Exemples de cellules traitées et de variations phénotypiques

Voici un exemple dans lequel des cellules traitées montrent des variations évidentes au niveau de leur phénotype ; seules trois des cinq longueurs d’onde figurent dans ce composite : noyaux en bleu, réticulum endoplasmique en vert, actine et appareil de Golgi en rouge.

 

Cellules non traitées témoins.

Cellules traitées avec de la roténone, une toxine fréquemment utilisée dans les insecticides. Elle est également connue pour inhiber la production d’ATP mitochondrial et s’est révélée avoir une activité anticancéreuse dans diverses cellules cancéreuses.

Cellules traitées avec de la chloroquine. La chloroquine a été développée pour la première fois pour le traitement du paludisme.

Protocole général du test de marquage cellulaire

En savoir plus sur le marquage cellulaire

Le marquage cellulaire devient un outil précieux grâce à ses nombreuses applications potentiellement importantes, notamment dans la découverte des médicaments. Découvrez comment optimiser vos capacités d’imagerie haut contenu et réaliser des tests multiplexés en utilisant des modules préconfigurés ou personnalisés du logiciel MetaXpress afin d’obtenir un profil phénotypique riche en données.